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贡红日

性别: 男

部门: 生物化学与分子生物学系

电话: 000-0000000

办公地址: 生命科学学院生物楼

职称: 教授

招生专业: 生物化学与分子生物学

邮箱: gonghr@nankai.edu.cn

通讯地址: 天津市南开区卫津路94号 [300071]

个人简介

南开大学杰出教授、二级教授,博士生导师,本硕博分别毕业于江西农业大学、浙江大学及南开大学,专注氧化磷酸化系统的前沿基础与创新应用研究,先后获得青年科学基金项目(B类)[原国家优秀青年科学基金项目]、国家重点研发计划青年科学家项目(主持)、教育部U40项目、青年科学基金项目(A类)[原国家杰出青年科学基金项目]、国家基础研究人才专项等资助,以通讯作者或第一作者身份在Nature、Science、Molecular Cell、Nature Communications、Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America、eLife等期刊发表多篇研究论文。担任天津市蛋白质科学重点实验室主任及天津市生物化学与分子生物学会理事长,并担任 Nature、Nature Chemical Biology、Nature Communications、Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 等期刊审稿人及国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目评审专家。

教育经历

工作经历

2021.12 —— 今 教授 2019.07 —— 2021.12 副教授

研究方向

能量生物学实验室

Laboratory of Energy Biology & Oxidative Phosphorylation

能量驱动生命,呼吸铸就活力。所有生命活动均由能量驱动,而腺苷三磷酸(ATP)正是这一生命能量的通用货币。作为普遍存在于生物界的能量代谢核心过程,呼吸作用在需氧细胞中扮演着关键角色:糖类、脂肪和蛋白质经过氧化分解释放电子与质子,这些电子在真核生物的线粒体内膜或原核生物的细胞质膜上,经由一系列精密排列的电子传递载体,最终交付于氧分子生成水;与此同时,跨膜质子梯度得以建立。这一从供氢体延伸至氧气的电子传递序列构成了呼吸链,其与ATP合成的紧密耦合即为氧化磷酸化——地球生命体最为核心的能量转换机制。然而,能量产生并非没有代价:氧化磷酸化过程中伴随生成的活性氧(ROS),一旦过量积累,便与衰老过程及多种人类疾病密切相关。

科学前沿与转化应用的交汇点。随着生物化学、细胞生物学、分子生物学、生物物理学及药学等学科的交叉融合与纵深发展,氧化磷酸化系统与病原菌致病机制、肿瘤恶性进展、神经退行性疾病等重大健康问题之间的关联日益凸显,使其成为极具前景的药物开发新靶点。近半个世纪的探索已结出硕果:全球首个抗结核新药贝达喹啉通过精准靶向结核分枝杆菌的ATP合成酶发挥杀菌作用,开创了结核病治疗的新纪元;人源ATP合成酶也被证实为治疗依赖氧化磷酸化供能的白血病等恶性肿瘤的潜在突破口;而针对真菌氧化磷酸化系统复合物II(琥珀酸脱氢酶)的新型杀菌剂,更已成为全球农药市场的明星产品。此外,深入解析生物体内的活性氧清除系统并加以精准调控,同时干预能量代谢平衡,有望为阿尔茨海默病等衰老相关疾病的防治开辟全新路径。

深耕基础,引领转化。本研究团队长期深耕于氧化磷酸化系统的前沿领域,既致力于揭示其基础科学奥秘,又积极推动该系统在结核病精准治疗、农业可持续发展等关键领域的创新应用与实践转化,力求实现从科学发现到社会价值的跨越。






科研成果

2024年7月在国际顶级学术期刊《Nature》发表题为“Inhibition of M. tuberculosis and human ATP synthase by BDQ and TBAJ-587”的研究论文,在国际上首次解析了结核分枝杆菌ATP合成酶和结合BDQ及其衍生物TBAJ-587的高分辨率电镜结构,并解析了人源ATP合成酶结合BDQ的高分辨率电镜结构,阐释了BDQ及其衍生物TBAJ-587抑制结核分枝杆菌ATP合成酶的分子机理,同时揭示了它们与人源ATP合成酶间的交叉反应机制,对于开发新一代高选择性的抗结核药物具有重要指导意义。链接:https://doi.org/10.1038/s41586-024-07605-8


2023年6月在国际著名学术期刊《Molecular Cell》发表题为“Structure of the human ATP synthase”的研究论文,在国际上率先报道了人源ATP合酶四种构象的高分辨率电镜结构,进一步推进了对ATP合成酶合成/水解ATP过程中旋转催化机制的认识。此外,我们分析了相关临床突变致病的分子作用机制,发现报道的突变体多出现在亚基之间的接触面上,影响了复合物结构的稳定性,为疾病的理解和治疗提供了新的见解。人源ATP合成酶结构的解析将为开发靶向性更好、副作用更低的抗结核药物以及抗肿瘤药物奠定基础。链接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2023.04.029


20234月在国际著名学术期刊《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》发表题为“Structure of the human respiratory complex II”的研究论文,解析人源线粒体呼吸链复合物II高分辨率的电镜结构,阐明了其结构特征并提出了电子传递机制。我们同时分析了相关临床突变致病的分子作用机制,发现报道的突变体影响复合物结构的稳定性,为疾病的理解和治疗提供了新的见解。本研究也将为开发靶向性更好、副作用更低的抗结核药物以及抗肿瘤药物奠定基础。链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2216713120


2023年1月在国际著名药物化学期刊《European Journal of Medicinal Chemistry》发表题为“Discovery of 1-hydroxy-2-methylquinolin-4 (1H)-one derivatives as new cytochrome bd oxidase inhibitors for tuberculosis therapy”的研究论文,报道了一种新的有望成为抗结核药物的结核分枝杆菌呼吸链细胞色素bd复合物抑制剂。链接:https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2022.114896


202111月在国际著名学术期刊《eLife》发表题为“Structure of Mycobacterium tuberculosis cytochrome bcc in complex with Q203 and TB47, two anti-TB drug candidates ” 的研究论文,阐明抗结核候选药物Q203TB47发挥特异性杀菌功能的分子机理,为进一步优化上述候选药物及开发更为有效的抗结核新药都将起到巨大的推动作用。链接:https://doi.org/10.7554/eLife.69418


2021 7月在国际著名学术期刊《Nature Communications》发表题为 “Cryo-EM structure of mycobacterial cytochrome bd reveals two oxygen access channels” 的研究论文,解析耻垢分枝杆菌细胞色素bd复合物的高分辨率电镜结构,提出一种新的醌氧化与氧还原相偶联的催化机制。链接:https://doi.org/10.1038/s41467-021-24924-w


20214月在国际著名学术期刊《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》在线发表题为“Architecture of the mycobacterial succinate dehydrogenase with a membrane-embedded Rieske FeS cluster” 的研究论文,解析耻垢分枝杆菌呼吸链复合物琥珀酸脱氢酶(Sdh1)天然状态及与底物结合状态的两种高分辨率电镜结构,为抗结核病的药物开发提供了结构基础。链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2022308118

 

20214月在国际著名学术期刊《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》表题为 “Cryo-EM structure of Mycobacterium smegmatis DyP-loaded encapsulin” 的研究论文,运用单颗粒冷冻电镜技术首次成功解析了一种天然提取的、装载DyP蛋白的分枝杆菌蛋白纳米隔室高分辨率三维结构,揭示了纳米隔室系统清除过氧化氢保护细胞免受氧化损伤的分子机制,为抗结核病的药物开发提供了结构基础。链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2025658118


20208月在国际著名学术期刊《Nature Communications》发表题为“Cryo-EM structure of trimeric Mycobacterium smegmatis succinate dehydrogenase with a membrane-anchor SdhF”的研究论文,解析耻垢分枝杆菌呼吸链琥珀酸脱氢酶(Sdh2)的高分辨率电镜结构,为抗结核病的药物开发提供了结构基础。链接:https://doi.org/10.1038/s41467-020-18011-9

 

201810月在国际顶级学术期刊《Science》发表题为“An electron transfer path connects subunits of a mycobacterial respiratory supercomplex”的研究论文,解析耻垢分枝杆菌呼吸链超级复合物III2IV4SOD2的高分辨率电镜结构,揭示生命体内一种新的醌氧化与氧还原相偶联的电子传递机制。此外,我们首次通过结构生物学的研究,发现超氧化物歧化酶直接参与呼吸链系统氧化还原酶超级复合物的组装,并协同工作的现象。链接:http://doi.org/10.1126/science.aat8923




社会兼职

天津市生物化学与分子生物学会理事长

天津市医学会微生物学与免疫学分会委员

天津市传染病疫情风险评估专家组成员

天津市南开区青年联合会第七届委员会委员

中国防痨协会青年理事会委员

中华医学会结核病学分会基础学组委员




教学经历

本科生《致命的敌人》


荣誉称号

2025 南开大学教书育人先进个人

2023 南开大学青年五四奖章获奖者

2019 吴瑞奖学金

2018 首届天津青年创新能手


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